Вы - морской спецназовец, находившийся на службе на американской подводной лодке Volarus. Ваша субмарина атакована и уничтожена неизвестным судном, которым вероятнее всего является русский атомный крейсер. Вам удалось выжить в катастрофе и выбраться на неизвестный тропический остров. Ситуация, как вы понимаете, более чем печальная. Судьба всего человечества теперь находится в ваших руках. В игре Mystery Island II используются элементы квеста, головоломки и научной фантастики, которые создают захватывающую атмосферу. Игрок должен находить и использовать различные предметы, оставаться целым и невредимым и, в конце концов, уничтожить злобных инопланетян и спасти Землю.