В игре вы превращаетесь в коммандоса - бравого вояку под кодовым именем Havoc, а в жизни капитана Ника Паркера.
Если вы играли в C&C, то должны помнить, что в мире существуют две воинствующие группировки: Global Defense Initiative (подобие ООН) и международной террористической организации Brotherhood of NOD. Цель последних - завоевание всего мира и установление нового порядка.